Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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COL24A1Q17RW2 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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