Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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SGCAQ16586 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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SGCAQ16586 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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