Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 FAM9B-203ENST00000428477 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms