Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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