Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
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