Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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