Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms