Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

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Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms