Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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