Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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CALCOCO2Q13137 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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CALCOCO2Q13137 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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CALCOCO2Q13137 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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CALCOCO2Q13137 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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CALCOCO2Q13137 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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CALCOCO2Q13137 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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CALCOCO2Q13137 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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