Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TROQ12816 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TROQ12816 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TROQ12816 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TROQ12816 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TROQ12816 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TROQ12816 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TROQ12816 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TROQ12816 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TROQ12816 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TROQ12816 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TROQ12816 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TROQ12816 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TROQ12816 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TROQ12816 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TROQ12816 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TROQ12816 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TROQ12816 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TROQ12816 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TROQ12816 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TROQ12816 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TROQ12816 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TROQ12816 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TROQ12816 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TROQ12816 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TROQ12816 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TROQ12816 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TROQ12816 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TROQ12816 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TROQ12816 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TROQ12816 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TROQ12816 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TROQ12816 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TROQ12816 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TROQ12816 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TROQ12816 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TROQ12816 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TROQ12816 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TROQ12816 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TROQ12816 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TROQ12816 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TROQ12816 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TROQ12816 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TROQ12816 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TROQ12816 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TROQ12816 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TROQ12816 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TROQ12816 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TROQ12816 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TROQ12816 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TROQ12816 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TROQ12816 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TROQ12816 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TROQ12816 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TROQ12816 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TROQ12816 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TROQ12816 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TROQ12816 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TROQ12816 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TROQ12816 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TROQ12816 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TROQ12816 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TROQ12816 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TROQ12816 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TROQ12816 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TROQ12816 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TROQ12816 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TROQ12816 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TROQ12816 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TROQ12816 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TROQ12816 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TROQ12816 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TROQ12816 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TROQ12816 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TROQ12816 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TROQ12816 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TROQ12816 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TROQ12816 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TROQ12816 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TROQ12816 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TROQ12816 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TROQ12816 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TROQ12816 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TROQ12816 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TROQ12816 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TROQ12816 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TROQ12816 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TROQ12816 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TROQ12816 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TROQ12816 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TROQ12816 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TROQ12816 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TROQ12816 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TROQ12816 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TROQ12816 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TROQ12816 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TROQ12816 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TROQ12816 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TROQ12816 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TROQ12816 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
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