Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms