Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE4BQ07343 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms