Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms