Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UFM1P61960 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
UFM1P61960 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UFM1P61960 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UFM1P61960 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UFM1P61960 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
UFM1P61960 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UFM1P61960 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UFM1P61960 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UFM1P61960 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UFM1P61960 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UFM1P61960 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UFM1P61960 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UFM1P61960 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UFM1P61960 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UFM1P61960 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UFM1P61960 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UFM1P61960 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UFM1P61960 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UFM1P61960 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UFM1P61960 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UFM1P61960 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UFM1P61960 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UFM1P61960 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UFM1P61960 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UFM1P61960 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UFM1P61960 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UFM1P61960 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UFM1P61960 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UFM1P61960 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UFM1P61960 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UFM1P61960 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UFM1P61960 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UFM1P61960 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UFM1P61960 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UFM1P61960 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UFM1P61960 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UFM1P61960 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UFM1P61960 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UFM1P61960 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UFM1P61960 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UFM1P61960 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UFM1P61960 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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