Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BACE1P56817 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BACE1P56817 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BACE1P56817 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BACE1P56817 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BACE1P56817 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BACE1P56817 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BACE1P56817 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BACE1P56817 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BACE1P56817 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BACE1P56817 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BACE1P56817 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BACE1P56817 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BACE1P56817 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BACE1P56817 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BACE1P56817 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BACE1P56817 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BACE1P56817 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BACE1P56817 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BACE1P56817 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BACE1P56817 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BACE1P56817 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BACE1P56817 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BACE1P56817 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BACE1P56817 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BACE1P56817 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BACE1P56817 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BACE1P56817 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BACE1P56817 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BACE1P56817 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BACE1P56817 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BACE1P56817 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BACE1P56817 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BACE1P56817 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BACE1P56817 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BACE1P56817 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BACE1P56817 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BACE1P56817 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BACE1P56817 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BACE1P56817 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BACE1P56817 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BACE1P56817 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BACE1P56817 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BACE1P56817 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BACE1P56817 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BACE1P56817 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BACE1P56817 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BACE1P56817 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BACE1P56817 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BACE1P56817 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BACE1P56817 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BACE1P56817 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BACE1P56817 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BACE1P56817 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BACE1P56817 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BACE1P56817 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BACE1P56817 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BACE1P56817 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BACE1P56817 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BACE1P56817 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BACE1P56817 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BACE1P56817 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BACE1P56817 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BACE1P56817 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BACE1P56817 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BACE1P56817 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BACE1P56817 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BACE1P56817 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BACE1P56817 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BACE1P56817 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BACE1P56817 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BACE1P56817 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BACE1P56817 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BACE1P56817 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BACE1P56817 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BACE1P56817 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BACE1P56817 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BACE1P56817 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BACE1P56817 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BACE1P56817 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BACE1P56817 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BACE1P56817 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BACE1P56817 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BACE1P56817 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BACE1P56817 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BACE1P56817 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BACE1P56817 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BACE1P56817 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BACE1P56817 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BACE1P56817 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BACE1P56817 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BACE1P56817 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BACE1P56817 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BACE1P56817 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BACE1P56817 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BACE1P56817 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BACE1P56817 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BACE1P56817 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BACE1P56817 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BACE1P56817 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms