Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms