Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms