Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJB2P29033 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJB2P29033 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJB2P29033 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJB2P29033 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJB2P29033 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJB2P29033 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJB2P29033 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJB2P29033 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJB2P29033 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJB2P29033 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJB2P29033 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJB2P29033 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJB2P29033 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJB2P29033 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJB2P29033 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJB2P29033 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJB2P29033 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJB2P29033 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJB2P29033 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJB2P29033 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJB2P29033 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJB2P29033 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GJB2P29033 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJB2P29033 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GJB2P29033 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJB2P29033 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJB2P29033 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJB2P29033 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJB2P29033 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJB2P29033 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJB2P29033 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJB2P29033 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJB2P29033 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJB2P29033 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJB2P29033 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJB2P29033 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJB2P29033 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GJB2P29033 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJB2P29033 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJB2P29033 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJB2P29033 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJB2P29033 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB2P29033 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB2P29033 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB2P29033 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB2P29033 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB2P29033 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB2P29033 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB2P29033 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB2P29033 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB2P29033 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB2P29033 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB2P29033 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB2P29033 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB2P29033 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB2P29033 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB2P29033 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB2P29033 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB2P29033 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB2P29033 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB2P29033 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB2P29033 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB2P29033 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB2P29033 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB2P29033 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB2P29033 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB2P29033 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB2P29033 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB2P29033 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB2P29033 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB2P29033 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB2P29033 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB2P29033 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB2P29033 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB2P29033 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB2P29033 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB2P29033 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB2P29033 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB2P29033 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB2P29033 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB2P29033 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB2P29033 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB2P29033 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB2P29033 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB2P29033 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB2P29033 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB2P29033 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB2P29033 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB2P29033 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB2P29033 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB2P29033 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB2P29033 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB2P29033 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB2P29033 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB2P29033 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB2P29033 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB2P29033 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB2P29033 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB2P29033 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms