Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
POLD1P28340 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
POLD1P28340 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLD1P28340 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLD1P28340 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLD1P28340 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLD1P28340 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLD1P28340 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLD1P28340 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLD1P28340 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLD1P28340 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLD1P28340 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLD1P28340 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLD1P28340 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLD1P28340 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
POLD1P28340 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
POLD1P28340 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLD1P28340 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLD1P28340 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLD1P28340 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLD1P28340 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLD1P28340 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLD1P28340 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLD1P28340 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLD1P28340 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLD1P28340 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLD1P28340 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLD1P28340 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLD1P28340 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLD1P28340 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD1P28340 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD1P28340 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD1P28340 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD1P28340 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD1P28340 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD1P28340 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD1P28340 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD1P28340 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD1P28340 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD1P28340 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD1P28340 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD1P28340 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD1P28340 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD1P28340 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD1P28340 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD1P28340 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD1P28340 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD1P28340 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD1P28340 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD1P28340 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD1P28340 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD1P28340 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD1P28340 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD1P28340 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD1P28340 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD1P28340 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD1P28340 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD1P28340 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD1P28340 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD1P28340 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD1P28340 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD1P28340 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD1P28340 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD1P28340 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD1P28340 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLD1P28340 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLD1P28340 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLD1P28340 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLD1P28340 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLD1P28340 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLD1P28340 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLD1P28340 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLD1P28340 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLD1P28340 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLD1P28340 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLD1P28340 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLD1P28340 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLD1P28340 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLD1P28340 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLD1P28340 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLD1P28340 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLD1P28340 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLD1P28340 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLD1P28340 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLD1P28340 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLD1P28340 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
POLD1P28340 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLD1P28340 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLD1P28340 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLD1P28340 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLD1P28340 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
POLD1P28340 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLD1P28340 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLD1P28340 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLD1P28340 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLD1P28340 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLD1P28340 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLD1P28340 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLD1P28340 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLD1P28340 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms