Protein–RNA interactions for Protein: O75439

PMPCB, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMPCBO75439 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms