Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KDELR3O43731 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KDELR3O43731 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KDELR3O43731 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms