Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms