Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 221.8 ms