Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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