Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC20■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC20■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC20■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC20■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC20■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC20■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.8 ms