Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms