Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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