Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms