Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms