Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 AC008555.2-202ENST00000601776 5302 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 HERC2P3-204ENST00000426501 5995 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 TGFBRAP1-203ENST00000595531 5595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 SIGLEC8-201ENST00000321424 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 ST3GAL6-202ENST00000394162 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 MME-204ENST00000462745 3590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 AL353616.1-201ENST00000436315 2860 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 OACYLP-201ENST00000417918 2208 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 TP63-209ENST00000437221 2500 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 LPXN-203ENST00000528954 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 LILRB1-202ENST00000396315 2157 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 RPL32P3-206ENST00000510078 2161 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 PCDHAC1-201ENST00000253807 5299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 COPS8-201ENST00000354371 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 DPH2-201ENST00000255108 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 AC009108.4-201ENST00000623284 2451 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 CSNK1G1-207ENST00000634654 2485 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 PDHA1-213ENST00000545074 3391 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 REXO5-201ENST00000261377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 AC107892.1-201ENST00000577382 2727 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 AK2-215ENST00000629371 3576 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 URB2-201ENST00000258243 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 FLT4-206ENST00000502649 4140 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 USP20-202ENST00000358355 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 ADGRE2-206ENST00000594294 2325 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 CRP-201ENST00000255030 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 LINC00452-202ENST00000609661 2896 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 ZSCAN30-211ENST00000610712 3439 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 GTSE1-201ENST00000454366 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 RAB6A-201ENST00000310653 3389 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 2500 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 HDAC6-201ENST00000334136 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 ANGPTL7-201ENST00000376819 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 SOCS2-AS1-201ENST00000499137 3325 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 PRICKLE1-209ENST00000552240 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 DGCR8-202ENST00000383024 4419 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 MAN1C1-202ENST00000374329 2461 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 HTR2C-203ENST00000371951 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 TARS2-214ENST00000606933 2162 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 LRRC55-201ENST00000497933 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 ABCA8-201ENST00000269080 5677 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 CAST-223ENST00000508608 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 LACC1-203ENST00000441843 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 TSPAN9-206ENST00000537971 4284 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 SPATA13-202ENST00000382095 6665 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 PLEKHG4-202ENST00000379344 4513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 ORMDL2-201ENST00000243045 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 A1CF-204ENST00000373997 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 PPIP5K1-201ENST00000334933 5586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 PPIP5K1-203ENST00000360135 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 PPIP5K1-204ENST00000360301 5565 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 PPIP5K1-206ENST00000381885 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 PRLR-211ENST00000511486 1566 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 ZNF700-201ENST00000254321 2882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 MPRIP-205ENST00000395811 10960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms