Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms