Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD35Q8N283 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD35Q8N283 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD35Q8N283 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD35Q8N283 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD35Q8N283 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD35Q8N283 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD35Q8N283 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD35Q8N283 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD35Q8N283 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD35Q8N283 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD35Q8N283 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD35Q8N283 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD35Q8N283 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD35Q8N283 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD35Q8N283 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD35Q8N283 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD35Q8N283 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD35Q8N283 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD35Q8N283 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD35Q8N283 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms