Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms