Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms