Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms