Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms