Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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