Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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PTPRRQ15256 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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PTPRRQ15256 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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PTPRRQ15256 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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PTPRRQ15256 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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PTPRRQ15256 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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PTPRRQ15256 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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PTPRRQ15256 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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PTPRRQ15256 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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PTPRRQ15256 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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