Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms