Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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