Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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