Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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