Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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RAB40BQ12829 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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RAB40BQ12829 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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RAB40BQ12829 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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RAB40BQ12829 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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RAB40BQ12829 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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RAB40BQ12829 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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RAB40BQ12829 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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RAB40BQ12829 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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RAB40BQ12829 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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