Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms