Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms