Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms