Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms