Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEMP55040 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEMP55040 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEMP55040 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEMP55040 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEMP55040 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEMP55040 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEMP55040 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEMP55040 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEMP55040 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEMP55040 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEMP55040 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEMP55040 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GEMP55040 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEMP55040 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEMP55040 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEMP55040 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEMP55040 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEMP55040 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEMP55040 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEMP55040 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEMP55040 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEMP55040 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEMP55040 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEMP55040 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEMP55040 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEMP55040 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEMP55040 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEMP55040 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GEMP55040 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEMP55040 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEMP55040 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEMP55040 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEMP55040 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEMP55040 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEMP55040 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms