Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ME1P48163 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ME1P48163 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ME1P48163 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ME1P48163 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ME1P48163 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ME1P48163 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ME1P48163 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ME1P48163 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ME1P48163 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ME1P48163 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ME1P48163 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ME1P48163 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ME1P48163 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ME1P48163 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ME1P48163 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ME1P48163 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ME1P48163 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ME1P48163 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ME1P48163 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ME1P48163 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ME1P48163 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ME1P48163 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ME1P48163 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ME1P48163 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ME1P48163 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ME1P48163 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ME1P48163 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ME1P48163 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ME1P48163 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ME1P48163 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ME1P48163 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ME1P48163 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ME1P48163 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ME1P48163 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ME1P48163 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ME1P48163 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ME1P48163 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ME1P48163 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ME1P48163 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ME1P48163 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ME1P48163 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ME1P48163 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ME1P48163 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ME1P48163 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ME1P48163 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ME1P48163 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ME1P48163 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ME1P48163 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ME1P48163 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ME1P48163 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ME1P48163 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ME1P48163 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ME1P48163 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ME1P48163 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ME1P48163 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ME1P48163 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ME1P48163 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ME1P48163 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ME1P48163 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ME1P48163 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ME1P48163 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ME1P48163 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ME1P48163 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ME1P48163 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ME1P48163 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ME1P48163 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ME1P48163 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ME1P48163 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ME1P48163 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ME1P48163 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ME1P48163 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ME1P48163 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ME1P48163 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ME1P48163 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ME1P48163 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ME1P48163 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ME1P48163 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ME1P48163 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ME1P48163 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ME1P48163 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ME1P48163 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ME1P48163 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ME1P48163 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ME1P48163 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ME1P48163 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ME1P48163 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ME1P48163 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ME1P48163 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ME1P48163 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ME1P48163 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ME1P48163 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ME1P48163 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ME1P48163 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ME1P48163 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ME1P48163 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ME1P48163 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ME1P48163 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ME1P48163 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ME1P48163 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms